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细菌 Cas9 核酸酶是一种RNA引导的DNA核酸内切酶，见于细菌CRISPR防卫系统中，也被广泛用作一种遗传工程工具。Cas9与一个引导RNA结合，与互补双螺旋DNA形成一个复合物，还会将DNA分解。要使分解发生，DNA目标就必须含有一个被称为PAM的三核苷酸主题。
Martin Jinek及同事解决了结合到一个引导RNA和一个含PAM的双螺旋DNA上的Cas9的结构。该结构显示了对DNA目标中的PAM的碱基特异性识别，怎样在PAM的紧上游导致DNA中局部化的链分离，从而让目标DNA链杂合到引导RNA 上。